Biologia Molecular da Celula
Objectives
São objetivos desta UC, fornecer aos alunos conhecimentos, capacidades e competências para utilizar ferramentas bioinformáticas e aplicações computacionais: 1. No estudo de sequências de DNA, de genes de interesse e de genomas 2. Na análise das propriedades, estrutura e função de proteínas 3. Na inferência das relações filogenéticas e evolutivas entre moléculas ou organismos 4. No estudo da variação e estrutura genética de populações humanas e de agentes infeciosos.
General characterization
Code
55730381
Credits
4
Responsible teacher
João Pinto
Hours
Weekly -
Total - Available soon
Teaching language
Português. Bibliografia em inglês.
Prerequisites
Bibliography
• Claverie J-M, Notredame C. 2007. Bioinformatics for dummies, 2nd Ed. Wiley Publishing. 436p. • Lemey P, Salemi M, Vandamme A-M. 2009. The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing, 2nd Ed. Cambridge University Press. 750p. • Hartl DL, Clark AG. 2007. Principles of Population Genetics, 4th Ed. Sinauer Associates. 545p.
Teaching method
Esta UC utilizará os seguintes elementos e métodos de ensino: 1. Aulas teóricas (método expositivo) 2. Aulas teórico-práticas (método expositivo/demonstrativo) 3. Aulas práticas (método demonstrativo/ativo) A avaliação dos alunos será efetuada através da realização de um exame prático com um exercício para o qual os alunos deverão aplicar ferramentas bioinformáticas para a sua resolução. Os alunos serão classificados com uma nota de 0-20 valores.
Evaluation method
A avaliação do curso será efetuada por intermédio do inquérito padrão do IHMT para avaliação da satisfação dos alunos.
Subject matter
Esta UC estará organizada em 4 blocos temáticos: 1. Análise de sequências e genomas a. Conceitos de genoma e análise genómica b. Bases de dados de genomas c. Sequenciação e alinhamento de sequências d. Mapeamento genético e. Detecção in silico de mutações e métodos de genotipagem 2. Análise de proteínas a. Conceitos de tradução e de estrutura proteica b. Bases de dados de proteínas c. Previsão de estrutura proteica d. Análise de função proteica e. Proteómica, transcriptómica e metabolómica: conceitos e aplicações 3. Análise filogenética a. Conceitos de evolução molecular b. Métodos de reconstrução filogenética c. Testes de modelos de evolução d. Testes de pressão selectiva e. Análise de relógios moleculares f. Filogeografia 4. Soluções informáticas para genética populacional a. Conceitos de genética populacional b. Marcadores moleculares para estudos populacionais c. Bases de dados genotípicos d. Aplicações informáticas para análises de genética populacional