Bioquímica Geral B
Objetivos
Objectivos:
Pretende-se que o aluno compreenda as bases físico-químicas das relações entre a estrutura e a função das macromoléculas biológicas e a estratégia do metabolismo central. O ensino está organizado por forma a que o aluno seja confrontado com a necessidade de utilizar os conceitos teóricos na análise de resultados experimentais obtidos no laboratório e na resolução de problemas de aplicação.
No final desta unidade curricular o aluno deverá:
- Saber como são constituídas as proteínas e qual a sua organização estrutural;
- Conhecer as técnicas de purificação e caracterização de proteínas e saber seguir um processo de purificação, bem como avaliar a sua eficiência;
- Compreender os mecanismos de transporte/armazenamento do oxigénio pela hemoglobina/mioglobina e distinguir entre ligação cooperativa e não cooperativa;
- Utilizar modelos matemáticos para calcular os parâmetros cinéticos de enzimas Michaelianas na ausência e na presença de inibidores e qual o efeito da temperatura e do pH na velocidade das reacções;
- Conhecer as estruturas dos açúcares simples e dos polissacáridos;
- Saber a constituição dos ácidos nucleicos, as suas propriedades físico-químicas e as suas estruturas
- Conhecer o fluxo da informação genética do gene à proteína;
- Saber as estruturas dos lípidos e a organização das membranas biológicas; os diferentes tipos de transporte de solutos;
- Compreender o fluxo de energia na biosfera.
- Conhecer o caminho metabólico central, os seus pontos de regulação e a sua ligação à cadeia respiratória.
Caracterização geral
Código
7321
Créditos
6.0
Professor responsável
Teresa Sacadura Santos Silva
Horas
Semanais - 4
Totais - 55
Idioma de ensino
Português
Pré-requisitos
A revisão dos conceitos básicos de Química Geral e de Química Orgânica é recomendada.
Bibliografia
PRINCIPLES OF BIOCHEMISTRY
Voet, D., Voet, J.G. & Pratt, C.W.
John Wiley & Sons, Inc., New York, 3rd ed. 2008
BIOCHEMISTRY
Lubert Stryer
W. H. Freeman and Company, San Francisco. 6th Ed. 2007
LEHNINGER PRINCIPLES OF BIOCHEMISTRY
Nelson, D.L., & Cox, M.M.
W.H. Freeman and Company, San Francisco, 5th ed. 2008
Método de ensino
Aulas teóricas (2h , 14 semanas) e teórico-práticas (3h, 5 semanas letivas), com auxílio de diapositivos em Powerpoint; as aulas integram a lecionação do programa e a discussão e resolução de questões e problemas no âmbito da disciplina. Sessões práticas de laboratório e seminários (3h, 5 semanas letivas) em grupos de 3 a 4 alunos.
A preparação das sessões de trabalho laboratorial e o tratamento dos resultados experimentais constitui uma parte importante do trabalho desenvolvido em autonomia pelo aluno, mas está sujeita à avaliação e correcção pelo docente para que a formação do aluno seja completa tanto do ponto de vista teórico como experimental.
Método de avaliação
I. Condições gerais de participação, frequência e avaliação dadisciplina
1.
A disciplina de Bioquímica Geral B integra:
- Aulas teóricas (2h por semana)
- aulas teórico-práticas (5 sessões de 3h);
- aulas práticas de laboratório (4 sessões de 3h)
- sessão de apresentação de seminários (1 sessão de 3h)
2.
A frequência da disciplina é obtida pela participação em todas as aulas práticas de laboratório (obrigatórias), excepto nos casos previstos na lei, que deverão ser devidamente documentados. A parte prática da disciplina consiste na realização, em grupos de 3 ou de 4 alunos, de trabalhos práticos de laboratório, na preparação prévia desses trabalhos e discussão.
3.
A participação na sessão de apresentação de seminários é obrigatória, excepto nos casos previstos na lei, que deverão ser devidamente documentados. A apresentação do seminário é feita em grupo, mas a avaliação é individual. A apresentação e discussão terão a duração máxima de 25 minutos (15 min. apresentação seguida de 10 min. de discussão).
Serão componentes da avaliação, os conteúdos, a apresentação e discussão do seminário.
4.
A participação presencial nas aulas teóricas e teórico-práticas contribui para a aquisição dos conteúdos da UC; as aulas práticas permitem executar técnicas e compreender alguns dos conceitos teóricos.
5.
O processo de avaliação da disciplina inclui avaliações separadas das partes teórica, apresentação de seminários, e prática, e será realizado de acordo com o Regulamento Geral para a Avaliação de Conhecimentos da Faculdade de Ciências eTecnologia.
6.
Estão excluídos da avaliação da parte teórica da disciplina os alunos que não tenham frequentado a parte prática da disciplina.
7.
Não se prevê qualquer sessão de repetição extraordinária de trabalhos práticos de laboratório. Se, por absoluta necessidade, o aluno/a tiver que faltar à sessão prática que lhe compete no horário, deverá realizar o trabalho durante outra sessão prática do mesmo trabalho, para o que deverá consultar o horário das práticas afixado.
8.
Se um aluno frequentar a parte prática mas não tiver tido aprovação na parte teórica da disciplina, é-lhe conferida a frequência da parte prática da disciplina.
II - Avaliação da disciplina
9.
A avaliação da disciplina consiste na realização de 2 testes teóricos individuais; 1 teste prático individual; e a apresentação de 1 seminário, em grupo. A média dos testes teóricos, não arredondada, corresponde a 60% da nota final da disciplina; o teste prático corresponde a 20% da nota final da disciplina; a apresentação de seminário corresponde a 20% da nota final da disciplina. Serão aprovados à disciplina os alunos que tenham obtido na média dos testes teóricos, e na nota final, classificação maior ou igual a 9.5 valores (numa escala de 0 a 20).
10.
A avaliação da parte teórica por exame final consiste num exame individual que inclui toda a matéria, e corresponde a 60% da nota final. Para obter aproveitamento, a classificação neste exame terá de ser igual ou superior a 9.5.
11.
Os alunos podem apresentar-se para melhoria de nota apenas na modalidade de exame final, que irá corresponder a 60% da nota final. Para tal, deverão seguir as normas vigentes. A nota do seminário ou do teste prático não estão sujeitas a melhoria.
Para os alunos com frequência obtida em anos anteriores, o cálculo da nota final será efectuado de acordo com o regulamento do ano correspondente.
Conteúdo
Programa resumido
- Introdução à Bioquímica (estruturas biológicas, processos metabólicos, expressão e transmissão de informação genética).
- Propriedades físico-químicas dos aminoácidos: ligação peptídica, classificação e características, propriedades ácido base.
- As proteínas e sua caracterização: aspectos estruturais (Estrutura primária, secundária - hélices alfa, folhas beta e dobras, terciária e quaternária); purificação; sequenciação; critérios de pureza e métodos de determinação de estrutura.
- Relação estrutura-função em macromoléculas biológicas: transporte de oxigénio e dióxido de carbono (hemoglobina e mioglobina).
- As enzimas: conceitos gerais; cinética enzimática (modelo de Michaelis-Menten); inibição; efeito do pH.
- Hidratos de carbono: classificação e função; monossacáridos e polissacáridos; glicoproteínas.
- Lípidos. Membranas biológicas (modelo do mosaico fluido) e transporte biológico: pasivo, facilitado e activo.
- Ác. nucleicos (RNA e DNA): estrutura e função. Desnaturação e renaturação dos ácidos nucleicos.
- O fluxo da informação genética: do gene à proteína.
- Introdução à tecnologia de DNA recombinante: endonucleases de restrição; sequenciação de DNA pelo método da adição de didesoxirribonucleótidos; a PCR; vectores de clonagem e vectores de expressão; mutagénese dirigida.
- Introdução à bioenergética.
- O caminho metabólico central (glicólise e fermentação; gluconeogénese; ciclo do ácido cítrico): reacções e sua regulação. Fosforilação oxidativa: cadeia de transporte de electrões e síntese de ATP.
Programa resumido das aulas teórico-práticas
- Propriedades ácido-base dos aminoácidos e proteínas.
- Cinética enzimática.
- Ácidos nucleicos, lípidos e membranas biológicas. Transporte biológico.
- Metabolismo e bioenergética
Programa resumido das aulas práticas
Quatro sessões laboratoriais:
1. Titulação ácido-base de aminoácidos
2. Separação de compostos biológicos por cromatografia
3. Identificação de açúcares
4. Caracterização da beta-glucosidase produzida pelo fungo Fusarium graminearum