Genómica Evolutiva Avançada
Objetivos
Esta unidade curricular proporcionará aos alunos conhecimentos avançados em Genómica Evolutiva, e assenta sobre os conceitos e metodologias adquiridos durante o primeiro semestre, desenvolvendo-os e aplicando-os a novos desafios.
Os alunos serão expostos aos mecanismos de evolução molecular e a como esses processos afectam a evolução dos genes e genomas.
Os alunos também serão expostos a desenvolvimentos metodológicos recentes bem como a aplicações da Genómica Evolutiva ao estudo da diversidade natural e na investigação biomédica.
É pretendido que os alunos adquirem um pensamento crítico em genómica evolutiva, que saibam reconhecer consequências do processo evolutivo no estudo de genomas e conheçam as metodologias de análise mais relevantes.
Caracterização geral
Código
12498
Créditos
3.0
Professor responsável
José Paulo Nunes de Sousa Sampaio, Patrícia Filipa Homem de Campos Tavares de Brito
Horas
Semanais - 2
Totais - A disponibilizar brevemente
Idioma de ensino
Português
Pré-requisitos
A disponibilizar brevemente
Bibliografia
Bibliografia principal.
Anisimova, M., Ed. 2012. Genômica evolutiva. Métodos estatísticos e computacionais, Volume 1 e 2. Springer.
Lemey, P., Salemi, M., Vandamme, A-M., Eds. O manual de filogenia. Uma abordagem prática para análise filogenética e teste de hipóteses. Cambridge University Press, 2ª edição. 750pp.
Além dos livros listados, os alunos serão incentivados a ler artigos científicos que serão dados durante as aulas.
Método de ensino
A disponibilizar brevemente
Método de avaliação
A disponibilizar brevemente
Conteúdo
1. Mecanismos da evolução molecular
2. Evolução da estrutura do genoma em Eucariontes e Procariontes
3. Inferência filogenética a partir de dados genómicos
4. Genómica populacional aplicada à filogeografia e ao estudo da especiação
5. Evolução das doenças infecciosas em diferentes escalas – estrutura populacional em larga escala, aplicação a estudos de transmissão e evolução intra-hospedeiro.
5.1. Análise comparativa de genomas microbianos e pangenomes
5.2. Evolução viral e epidemiologia molecular
6. Metagenómica na análise do microbiota humano, em saúde e na doença
7. Evolução no cancro: evolução clonal e inferência da diversidade intratumoral
Cursos
Cursos onde a unidade curricular é leccionada: