Génomica e Proteómica aplicadas a Doenças Infeciosas

Objetivos

1. Aquisição de conhecimentos base relativos aos princípios subjacentes a técnicas gerais (incluindo sequenciação de DNA e RNA, produção/purificação de proteínas de forma recombinante e análises de interações destas entre si e com ácidos nucleicos) frequentemente utilizadas nos domínios da genómica e da proteómica.
2. Analisar de forma crítica as potencialidades analíticas/limites técnicos das diferentes abordagens apresentadas.
3. Demonstração de capacidade de discussão crítica do potencial/limitações das diferentes abordagens apresentadas quando aplicadas ao estudo de doenças infeciosas específicas ou dos seus vetores.

Caracterização geral

Código

9512026

Créditos

Professor responsável

Ricardo Parreira

Horas

Semanais - 7

Totais - 24

Idioma de ensino

Português

Pré-requisitos

A frequência de 2/3 das aulas é obrigatória

Bibliografia

• Arthur, L. (2012). Introduction to Genomics, 2nd ed. Oxford University Press, UK.
• Arthur, L. (2010). Introduction to Protein Science, 2nd ed. Oxford University Press, UK.
• Josip, L. (2011). Introducing Proteomics: From Concepts to Sample Separation, Mass Spectrometry and Data Analysis. Wiley-Blackwell, UK.
A bibliografia recomendada incluirá, adicionalmente, artigos científicos que cobrirão, de forma mais específica, cada uma das temáticas apresentadas.

Método de ensino

Devido (i) à multitude de especificidades técnicas das abordagens experimentais do domínio da genómica e proteómica e (ii) à formação heterogénea e insipiente dos alunos ao nível de 2º Ciclo, estes limitam a implementação, com sucesso, de aulas com componente prática. Assim, a experiência de anos anteriores levou-nos a optar por aumentar a componente de formação teórica, distribuída por aulas formais e seminários científicos, em detrimento da componente teórico-prática. No entanto, deve ser realçada a ligação estreita que esta UC tem com a de Bioinformática, caracterizada por uma forte componente prática, e versando sobre a análise genómica. É ainda privilegiada na UC presente a componente de orientação tutorial.

Método de avaliação

Tendo em consideração o reduzido número de ECTS associados a esta UC, a avaliação basear-se-á exclusivamente, no resultado de um exame escrito de tipo booleano (Verdadeiro/Falso).

Conteúdo

I. Introdução às tecnologias de sequenciação (automatizada) de fragmentos de DNA e genomas completos: Sanger vs NGS (Next Generation Sequening).
II. Produção de proteínas recombinantes em hospedeiros procariontes e eucariontes e sua purificação.
III. Interações entre proteínas e destas com ácidos nucleicos.
IV. Genómica Funcional, Microarrays de DNA e sequenciação de RNA.
V. Utilização de técnicas do domínio da Genómica e Proteómica ao estudo de: genómica populacional de vetores artrópodes, enzimopatias eritrocitárias e seus efeitos na infeção malárica, determinantes de resistência em P. falciparum a fármacos anti-maláricos, e ao estudo de infeções pelo vírus Hepatite D e ao cancro do fígado.

Cursos

Cursos onde a unidade curricular é leccionada:

Mestrado em Ciências Biomédicas