Epidemiologia molecular das doenças infeciosas e parasitárias
Objetivos
No fim desta unidade curricular os alunos deverão conseguir: 1. Identificar o que é a epidemiologia molecular. 2. Escolher e interpretar métodos de tipagem molecular. 3. Usar e interpretar métodos de análise molecular, como filogenética e genética populacional. 4. Analisar estudos geográficos de agentes infeciosos e parasitários e gerar hipóteses. 5. Criticar metodologias usadas em estudos de transmissão. 6. Avaliar evidências de uma ligação causal entre a presença de um organismo patogénico e uma doença ou patologia. 7. Discutir temas atuais de epidemiologia molecular em diferentes grupos de organismos patogénicos e na prática clínica. 8. Produzir e avaliar apresentações científicas escritas sobre epidemiologia molecular.
Caracterização geral
Código
5573040
Créditos
5
Professor responsável
Isabel Maurício
Horas
Semanais - 13,5
Totais - 40
Idioma de ensino
Português
Pré-requisitos
A frequência de 2/3 das aulas é obrigatória.
Bibliografia
• Molecular Epidemiology of Infectious Diseases. Principles and Practices. 2004 Ed Lee Riley. ASM Press. • Molecular Epidemiology: practical approach. Ed. Carrington and Hoelzel. 2001 Oxford University Press. • Tenover FC, Arbeit RD, Goering RV. How to select and interpret molecular strain typing methods for epidemiological studies of bacterial infections: a review for healthcare epidemiologists. Molecular Typing Working Group of the Society for Healthcare Epidemiology of America. Infect Control Hosp Epidemiol. 1997 Jun;18(6):426-39. • Paustenbach D, Galbraith D. Biomonitoring and biomarkers: exposure assessment will never be the same. Environ Health Perspect. 2006 Aug;114(8):1143-9.
Método de ensino
Ensino presencial: Aulas teóricas e Aulas teórico-práticas. A aprendizagem será apoiada por avaliação formativa e feedback, nas aulas práticas, discussões em aulas e baseada na versão inicial do trabalho escrito de análise de três artigos, com comentários de docentes e de outros alunos.
Método de avaliação
A avaliação sumativa será baseada na versão final do trabalho escrito.
Conteúdo
I. Introdução à UC. O que é a epidemiologia molecular. II. Metodologias e desenvolvimento de genotipagem. Erros de genotipagem. III. Revisão de conceitos de epidemiologia. IV.Associações geográficas. V. Estudos de transmissão direta. VI. Estudos de transmissão vetorial (indireta). VII. Estudos de patogenicidade. VIII. Biomarcadores. Conceitos e integração em estudos epidemiológicos. IX. Biobancos e a sua relevância na gestão de amostras biológicas: o estudo de caso do Biotropical Resources. X. Bioinformática e bases de dados para epidemiologia molecular. XI. Epidemiologia molecular de malária, fármacos e vacinas. XII. Biologia populacional: conceitos básicos e aplicação em epidemiologia molecular. XIII. Filogenética: conceitos básicos e aplicação em epidemiologia molecular. XIV. Exemplos: epidemias e transmissão de virus. XV. Exemplos: controlo de infecções bacterianas. XVI. Exemplos: estudos de relação entre helmintas e doenças consideradas não transmissíveis. XVII. Micoses e exemplos de aplicação de genotipagem em micologia médica. XVIII. Epidemiologia molecular das leishmanioses- aplicações práticas. XIX. The variability and reproducibility of whole genome sequencing technology for detecting resistance to anti-tuberculous drugs. XX. Metagenómica em Epidemiologia Molecular: projeto. XXI. Clínica: Molecular Pathological Epidemiology.